Beberapa faktor dapat berkontribusi pada perkembangan sindrom usus bocor, termasuk:
- Pola makan buruk yang tinggi akan makanan olahan dan gula rafinasi
- Stres kronis dan peningkatan kadar kortisol
- Konsumsi alkohol berlebihan
- Penggunaan obat antiinflamasi nonsteroid (NSAID) seperti ibuprofen
- Ketidakseimbangan bakteri usus
- Infeksi usus atau parasit
- Kecenderungan genetik
